La politique du Premier ministre arménien qui affecte de manière destructrice la société, a conduit à une sérieuse confrontation entre Nikol Pachinian et l'actuel président arménien. Après que Pachinian eut limogé le chef d'état-major de l'armée, Onik Gasparian, on a appris qu'Armen Sarkissian refusait de signer un décret de la nomination d'un nouveau chef d'état-major général des forces armées. L'Arménie a démontré ainsi sa volonté de faire obstacle aux actions du Premier ministre.
« Le président de la République a rejeté la proposition du Premier ministre de nommer Artak Davtyan chef d'état-major général des forces armées de la République d’Arménie», lit-on dans un message officiel publié à cet égard.
Selon certains rapports, le président arménien Armen Sarkissian a l'intention de faire réintégrer Onik Gasparian à son poste, car sinon l'état-major général des forces armées arméniennes restera vacant , ce qui nuira sérieusement à la réputation de Pachinian, parmi ses partisans.
Il convient de noter qu'officiellement Pachinian n'a jamais été en mesure d'expliquer sa propre déclaration selon laquelle le conflit armé au Haut-Karabakh avait échoué en raison de l'inutilité des armes russes.
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