Ces échanges de tirs, après un premier accrochage sérieux dans la capitale jeudi, ravivent les craintes d'un échec du fragile processus de paix en cours au Soudan du Sud.
Le pays s'apprête à marquer samedi, sans festivités, le cinquième anniversaire de son indépendance.
Vendredi, les reporters qui se trouvaient dans le palais présidentiel ont rapporté avoir entendu des rafales d'armes automatiques.
Les tirs ont d'abord été entendus aux abords du palais présidentiel, où le président Salva Kiir et son vice-président Riek Machar étaient réunis pour une conférence de presse, selon la même source.